2007ലെ ടി20 ലോകകപ്പിലാണ് ധോണി ആദ്യമായി ക്യാപ്റ്റനായി നിയോഗിക്കപ്പെടുന്നത്. ഈ ടൂര്ണമെന്റില് ടീമിന്റെ മാനേജരായിരുന്നു രാജ്പുത്. വളരെ ശാന്തപ്രകൃതമാണ് ധോണിയുടേത്. എല്ലായ്പ്പോഴും എതിരാളികളേക്കാള് രണ്ടടി മുമ്പ് തന്നെ അദ്ദേഹം ചിന്തിക്കും.
ഗാംഗുലിയുടെയും ദ്രാവിഡും ചേര്ന്നതാണ് ധോണി.. താരങ്ങള്ക്കു ആത്മവിശ്വാസം നല്കിയിരുന്ന ക്യാപ്റ്റനായിരുന്നു ഗാംഗുലി മാത്രമല്ല ഇന്ത്യന് ടീമിന്റെയാകെ മാനസികാവസ്ഥ മാറ്റിയെടുത്തതും അദ്ദേഹമായിരുന്നുവെന്ന് രാജ്പുത് അഭിപ്രായപ്പെട്ടു.
ഗാംഗുലിയെപ്പോലെ തന്നെ യുവതാരങ്ങളില് വലിയ വിശ്വാസമര്പ്പിച്ചിരുന്ന ക്യാപ്റ്റനായിരുന്നു ധോണി. ഗാംഗുലിയെപ്പോലെ തന്നെ ധോണിയും ഇത് മുന്നോട്ട് കൊണ്ടു പോവുകയായിരുന്നു. കഴിവുണ്ടെന്നു തോന്നുന്ന കളിക്കാര്ക്ക് ധോണി എല്ലായ്പ്പോഴും അവസരങ്ങള് നല്കിയിരുന്നു. അത്തരത്തിലുള്ള താരങ്ങളെ അദ്ദേഹം ഒരിക്കലും കൈവിട്ടിരുന്നില്ല.
ധോണി ഒരിക്കലും കളിക്കളത്തില് ഉത്തരവാദിത്വത്തില് നിന്നും ഒഴിഞ്ഞു മാറാന് ശ്രമിക്കാറില്ല. ഇത് താരങ്ങളെ തങ്ങളുടെ ഏറ്റവും മികച്ച പ്രകടനം പുറത്തെടുക്കാന് സഹായിക്കുകയും ചെയ്തതായി രാജ്പുത് വിശദമാക്കി. ടി20 ലോകകപ്പില് ഇന്ത്യയെ കിരീട വിജയത്തിലേക്കു നയിച്ച ശേഷം രാജ്പുത് ഐപിഎല്ലിന്റെ പ്രഥമ സീസണില് മുംബൈ ഇന്ത്യന്സിന്റെ കോച്ചായിരുന്നു. അഫ്ഗാനിസ്താന് ടീമിനെ പരിശീലിപ്പിച്ച രാജ്പുത് ഇപ്പോള് സിംബാബ്വെയുടെ കോച്ചായി പ്രവര്ത്തിക്കുകയാണ്.
പല സീനിയര് താരങ്ങളും പിന്മാറിയതിനെ തുടര്ന്നാണ് 2007ലെ പ്രഥമ ടി20 ലോകകപ്പില് ധോണിക്കു നായകനായി നറുക്കുവീണത്. ഇന്ത്യക്കു ലോകകപ്പ് സമ്മാനിച്ച അദ്ദേഹം എല്ലാവരുടെയും കണക്കുകൂട്ടലുകള് തെറ്റിക്കുകയും ചെയ്തു.
ലോകകപ്പിനു ശേഷം നടന്ന ഇംഗ്ലണ്ട് പര്യടനത്തിനു പിന്നാലെ രാഹുല് ദ്രാവിഡ് എകദിന ടീമിന്റെ ക്യാപ്റ്റന് സ്ഥാനമൊഴിഞ്ഞതോടെ സെലക്ടര്മാര്ക്കു ധോണിയെ ദൗത്യമേല്പ്പിക്കാന് കൂടുതല് ആലോചിക്കേണ്ടി വന്നില്ല. ഒരു വര്ഷത്തിനു ശേഷം ടെസ്റ്റ് നായകന് കൂടിയായ അനില് കുംബ്ലെ വിരച്ചതോടെ ടെസ്റ്റിലും ധോണി ക്യാപ്റ്റമായി നിയോഗിക്കപ്പെട്ടു. 2014ല് ടെസ്റ്റില് നിന്നു വിരമിക്കുന്നതു വരെ അദ്ദേഹം നായകസ്ഥാനത്തു തുടര്ന്നു. 2017ലാണ് ഏകദിന, ടി20 ടീമുകളുടെ ക്യാപ്റ്റന്സി ധോണി വിരാട് കോലിക്കു കൈമാറിയത്.